MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio alaskensis G20 chromosome

Total Repeats: 72442

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007519	A	7	7	194	200	100 %	0 %	0 %	0 %	78355048
2	NC_007519	GGT	2	6	250	255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78355048
3	NC_007519	T	7	7	317	323	0 %	100 %	0 %	0 %	78355048
4	NC_007519	CAC	2	6	392	397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78355048
5	NC_007519	GCT	2	6	415	420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355048
6	NC_007519	GCC	2	6	446	451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78355048
7	NC_007519	GCC	2	6	453	458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78355048
8	NC_007519	A	6	6	465	470	100 %	0 %	0 %	0 %	78355048
9	NC_007519	CAA	2	6	518	523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78355048
10	NC_007519	TTTC	2	8	530	537	0 %	75 %	0 %	25 %	78355048
11	NC_007519	GC	3	6	549	554	0 %	0 %	50 %	50 %	78355048
12	NC_007519	GCAG	2	8	612	619	25 %	0 %	50 %	25 %	78355048
13	NC_007519	CTG	2	6	633	638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355048
14	NC_007519	TA	3	6	670	675	50 %	50 %	0 %	0 %	78355048
15	NC_007519	A	6	6	675	680	100 %	0 %	0 %	0 %	78355048
16	NC_007519	CAG	2	6	759	764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78355048
17	NC_007519	CTG	2	6	783	788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355048
18	NC_007519	GAC	2	6	792	797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78355048
19	NC_007519	C	6	6	975	980	0 %	0 %	0 %	100 %	78355048
20	NC_007519	GCCG	2	8	1194	1201	0 %	0 %	50 %	50 %	78355048
21	NC_007519	CAG	2	6	1210	1215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78355048
22	NC_007519	AAT	2	6	1220	1225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78355048
23	NC_007519	GCC	2	6	1253	1258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78355048
24	NC_007519	CCA	2	6	1283	1288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78355048
25	NC_007519	TGG	2	6	1373	1378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78355048
26	NC_007519	A	7	7	1410	1416	100 %	0 %	0 %	0 %	78355048
27	NC_007519	GATA	2	8	1427	1434	50 %	25 %	25 %	0 %	78355048
28	NC_007519	GAA	2	6	1469	1474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78355048
29	NC_007519	AGC	2	6	1689	1694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78355049
30	NC_007519	CAT	2	6	1698	1703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78355049
31	NC_007519	GA	3	6	1892	1897	50 %	0 %	50 %	0 %	78355049
32	NC_007519	CGC	2	6	1948	1953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78355049
33	NC_007519	CCA	2	6	1967	1972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78355049
34	NC_007519	CGA	2	6	2082	2087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78355049
35	NC_007519	GCATGA	2	12	2111	2122	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	78355049
36	NC_007519	CCA	2	6	2166	2171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78355049
37	NC_007519	GCT	2	6	2211	2216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355049
38	NC_007519	A	6	6	2242	2247	100 %	0 %	0 %	0 %	78355049
39	NC_007519	GAA	2	6	2262	2267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78355049
40	NC_007519	ACA	2	6	2303	2308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78355049
41	NC_007519	TTC	2	6	2317	2322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78355049
42	NC_007519	ATG	2	6	2449	2454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78355049
43	NC_007519	ACA	2	6	2489	2494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78355049
44	NC_007519	AGG	2	6	2552	2557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78355049
45	NC_007519	ACG	2	6	2591	2596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78355049
46	NC_007519	TAC	2	6	2773	2778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78355049
47	NC_007519	GAA	2	6	2785	2790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78355049
48	NC_007519	ACG	2	6	2825	2830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78355050
49	NC_007519	GCA	2	6	2894	2899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78355050
50	NC_007519	GTG	2	6	2935	2940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78355050
51	NC_007519	CGA	2	6	2952	2957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78355050
52	NC_007519	AAG	2	6	3062	3067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78355050
53	NC_007519	TGC	2	6	3098	3103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355050
54	NC_007519	CGG	2	6	3108	3113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78355050
55	NC_007519	CGGG	2	8	3143	3150	0 %	0 %	75 %	25 %	78355050
56	NC_007519	GGGT	2	8	3158	3165	0 %	25 %	75 %	0 %	78355050
57	NC_007519	CGTG	2	8	3170	3177	0 %	25 %	50 %	25 %	78355050
58	NC_007519	CGT	2	6	3211	3216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355050
59	NC_007519	ATC	2	6	3230	3235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78355050
60	NC_007519	CAC	2	6	3300	3305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78355050
61	NC_007519	TCCG	2	8	3314	3321	0 %	25 %	25 %	50 %	78355050
62	NC_007519	GAA	2	6	3325	3330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78355050
63	NC_007519	A	6	6	3367	3372	100 %	0 %	0 %	0 %	78355050
64	NC_007519	GAG	2	6	3379	3384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78355050
65	NC_007519	G	6	6	3462	3467	0 %	0 %	100 %	0 %	78355050
66	NC_007519	GAA	2	6	3483	3488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78355050
67	NC_007519	CAT	2	6	3519	3524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78355050
68	NC_007519	TGG	2	6	3554	3559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78355050
69	NC_007519	CAA	2	6	3612	3617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78355050
70	NC_007519	AAGG	2	8	3628	3635	50 %	0 %	50 %	0 %	78355050
71	NC_007519	GCAC	2	8	3638	3645	25 %	0 %	25 %	50 %	78355050
72	NC_007519	CAA	2	6	3681	3686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78355050
73	NC_007519	TGA	2	6	3738	3743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78355050
74	NC_007519	GCC	2	6	3934	3939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78355050
75	NC_007519	CGC	2	6	3951	3956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78355050
76	NC_007519	TGCCC	2	10	4005	4014	0 %	20 %	20 %	60 %	78355050
77	NC_007519	GCTG	2	8	4020	4027	0 %	25 %	50 %	25 %	78355050
78	NC_007519	CAA	2	6	4191	4196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78355050
79	NC_007519	TCA	2	6	4211	4216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78355050
80	NC_007519	GAA	2	6	4240	4245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78355050
81	NC_007519	TCA	2	6	4283	4288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78355050
82	NC_007519	CCGACG	2	12	4292	4303	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	78355050
83	NC_007519	ACGC	2	8	4320	4327	25 %	0 %	25 %	50 %	78355050
84	NC_007519	TGC	2	6	4328	4333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355050
85	NC_007519	TTC	2	6	4339	4344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78355050
86	NC_007519	GCC	2	6	4395	4400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78355050
87	NC_007519	GT	3	6	4409	4414	0 %	50 %	50 %	0 %	78355050
88	NC_007519	ACA	2	6	4415	4420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78355050
89	NC_007519	CTG	2	6	4468	4473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355050
90	NC_007519	CGT	2	6	4491	4496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355050
91	NC_007519	CTG	2	6	4546	4551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355050
92	NC_007519	TCA	2	6	4565	4570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78355050
93	NC_007519	T	6	6	4660	4665	0 %	100 %	0 %	0 %	78355050
94	NC_007519	GT	3	6	4757	4762	0 %	50 %	50 %	0 %	78355050
95	NC_007519	TTC	2	6	4813	4818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78355050
96	NC_007519	GCG	2	6	4874	4879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78355050
97	NC_007519	TGG	2	6	4892	4897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78355050
98	NC_007519	CTG	2	6	4939	4944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355050
99	NC_007519	TGC	2	6	4952	4957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355050
100	NC_007519	GC	3	6	4963	4968	0 %	0 %	50 %	50 %	78355050
101	NC_007519	ACC	2	6	5032	5037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78355050
102	NC_007519	TGC	3	9	5057	5065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355050
103	NC_007519	CCGCG	2	10	5134	5143	0 %	0 %	40 %	60 %	78355050
104	NC_007519	AC	3	6	5190	5195	50 %	0 %	0 %	50 %	78355050
105	NC_007519	AAG	2	6	5245	5250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78355051
106	NC_007519	TTA	2	6	5276	5281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78355051
107	NC_007519	CAT	2	6	5334	5339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78355051
108	NC_007519	A	6	6	5383	5388	100 %	0 %	0 %	0 %	78355051
109	NC_007519	ACC	2	6	5423	5428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78355051
110	NC_007519	TGC	2	6	5666	5671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355051
111	NC_007519	CCA	2	6	5672	5677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78355051
112	NC_007519	CTG	2	6	5689	5694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355051
113	NC_007519	CCA	2	6	5729	5734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78355051
114	NC_007519	CCG	2	6	5740	5745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78355051
115	NC_007519	CTG	3	9	5773	5781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355051
116	NC_007519	CGG	2	6	5850	5855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78355051
117	NC_007519	GTGGAA	2	12	5929	5940	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	78355051
118	NC_007519	A	6	6	5947	5952	100 %	0 %	0 %	0 %	78355051
119	NC_007519	A	6	6	6014	6019	100 %	0 %	0 %	0 %	78355051
120	NC_007519	AACG	2	8	6034	6041	50 %	0 %	25 %	25 %	78355051
121	NC_007519	GCTG	2	8	6192	6199	0 %	25 %	50 %	25 %	78355051
122	NC_007519	TGG	2	6	6200	6205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78355051
123	NC_007519	GCT	2	6	6219	6224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355051
124	NC_007519	GCA	2	6	6255	6260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78355051
125	NC_007519	AC	3	6	6286	6291	50 %	0 %	0 %	50 %	78355051
126	NC_007519	CGA	2	6	6360	6365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78355051
127	NC_007519	CCG	2	6	6397	6402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78355051
128	NC_007519	GCT	2	6	6528	6533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355051
129	NC_007519	GAA	2	6	6571	6576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78355051
130	NC_007519	TGC	2	6	6578	6583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355051
131	NC_007519	GCG	2	6	6584	6589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78355051
132	NC_007519	CGG	2	6	6637	6642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78355051
133	NC_007519	CGA	2	6	6696	6701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78355051
134	NC_007519	TCA	2	6	6710	6715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78355051
135	NC_007519	CGCGG	2	10	6722	6731	0 %	0 %	60 %	40 %	78355051
136	NC_007519	CAG	3	9	6763	6771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78355051
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142	NC_007519	CTG	2	6	6955	6960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355051
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158	NC_007519	GCGT	2	8	7559	7566	0 %	25 %	50 %	25 %	78355051
159	NC_007519	CTGG	2	8	7572	7579	0 %	25 %	50 %	25 %	78355051
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170	NC_007519	GC	3	6	8374	8379	0 %	0 %	50 %	50 %	347359723
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250	NC_007519	GCCT	2	8	14375	14382	0 %	25 %	25 %	50 %	78355061
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257	NC_007519	GAT	2	6	14754	14759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78355061
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259	NC_007519	T	7	7	14907	14913	0 %	100 %	0 %	0 %	78355061
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262	NC_007519	GT	3	6	15150	15155	0 %	50 %	50 %	0 %	78355061
263	NC_007519	CCGGA	2	10	15384	15393	20 %	0 %	40 %	40 %	78355062
264	NC_007519	GCG	2	6	15575	15580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78355062
265	NC_007519	T	6	6	15688	15693	0 %	100 %	0 %	0 %	78355062
266	NC_007519	AAC	2	6	15737	15742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78355062
267	NC_007519	GT	3	6	15915	15920	0 %	50 %	50 %	0 %	78355062
268	NC_007519	GGC	2	6	15938	15943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78355063
269	NC_007519	GC	3	6	15950	15955	0 %	0 %	50 %	50 %	78355063
270	NC_007519	GCA	2	6	15967	15972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78355063
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285	NC_007519	CTG	3	9	17046	17054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355064
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389	NC_007519	CAG	2	6	22946	22951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78355075
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392	NC_007519	GGC	2	6	23138	23143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78355075
393	NC_007519	CAT	2	6	23224	23229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78355075
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396	NC_007519	ATCA	2	8	23375	23382	50 %	25 %	0 %	25 %	78355075
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398	NC_007519	TGC	2	6	23434	23439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355075
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454	NC_007519	GTT	3	9	26459	26467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347359725
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